马渐新

    2015-06-11 11:11:51           浏览数:0

马渐新,泰山学者海外特聘专家,青岛农业大学生命科学学院教授。美国普渡大学农学系终身教授,博士生导师。
 
1993年于莱阳农学院获学士学位,1996年和1999年于中国农科院获硕士和博士学位,系全国百篇优秀博士论文奖获得者。2000年至2005年在美国普渡大学和佐治亚大学做博士后研究,自2005年以来先后被普渡大学聘为遗传研究学家 (Research Geneticist, 2005-2006),研究助理教授 (Research Assistant Professor, 2006-2007),助理教授 (Assistant Professor, 2007-2011),副教授 (Associate Professor, 2011-2015),教授 (Professor, 2015-),及普渡大学议员 (2015- )。获得普渡大学成功种子奖和大学学者奖,及普渡大学农业研究奖,Sigma Xi研究奖,和kohls杰出教学奖等提名奖。
 
主要研究方向和兴趣为作物比较基因组学,植物转座子介导的结构,功能和进化基因组学,作物应用基因组学,作物驯化的遗传基础,基于基因组学的作物种质资源研究和基因发掘,及生物信息学等。其实验室已获得500多万美元研究经费支助。在包括Nature, Science, Nature Genetics, Nature Biotechnology, Genome Research, PNAS,Plant Cell, Genome Biology, Molecular Biology and Evolution, Trends in Genetics, Current Opinion in Plant Biology, Plant Journal, Plant Physiology, Genetics等在内的学术期刊发表论文70余篇。其中作为通讯或第一作者发表的研究论文包括Nature Genetics (1篇),Nature Biotechnology (1篇),Genome Research (3篇),PNAS (3篇),Plant Cell (6篇),Trends in Genetics (1篇),Current Opinion in Plant Biology (1篇),Plant Journal (2篇),Genetics (2篇)等。总计论文影响因子高于450,他引5800余次。担任美国国家科学基金委评委,美国农业部国家食物和农业研究项目评委,及中国国家自然基金委重点项目评委。为G3: Gene, Genome, Genetics, Crop Journal, American Journal of Molecular Biology等学术期刊的副主编(Associate Editor),以及包括Nature Genetics, Genome Research, Plant Cell, PNAS, PloS Genetics, Plant Physiology, Plant Journal, New Pgytologist, Molecular Plant等在内的40余家学术期刊的审稿人。为美国科学促进学会,美国生物学家学会,作物学会,大豆协会会员和Sigma Xi学会荣誉会员。任历年国际动植物基因组大会转座子分会主席。
 
教育经历:
2003-2005年:美国佐治亚大学遗传系,基因组学博士后,导师:Jeff Bennetzen教授,院士    
2000-2003年:美国普渡大学生物系,基因组学博士后,导师:Jeff Bennetzen教授,院士 
1993-1999年:中国农业科学院作物品种资源研究所,植物遗传育种学博士,导师:董玉琛研究员,院士,贾继增研究员          
1993-1996年:中国农业科学院作物品种资源研究所,植物遗传育种学硕士,导师:贾继增研究员
1989-1993年:莱阳农学院农学系,农学学士
 
工作经历:
2012-        青岛农业大学生命科学系教授,泰山学者海外特聘专家
2011-        美国普渡大学农学系,遗传与基因组学,副教授(终身教授)
2007-2011年:美国普渡大学农学系,遗传与基因组学,助理教授   
2006-2007年:美国普渡大学农学系,遗传与基因组学,研究助理教授   
2005-2006年:美国普渡大学农学系,遗传与基因组学,研究遗传学家   
1999-2000年:中国农业科学院作物品种资源研究所,助理研究员     
 
奖励和荣誉:
2012年:美国普渡大学“大学学者”奖
2011年:中国农科院油料研究所客座研究员
2011年:美国普渡大学“成功种子”奖   
2010年:美国普渡大学“成功种子”奖   
2009年:美国普渡大学“成功种子”奖   
2009年:美国普渡大学农学院“百万富翁俱乐部”奖    
2001年:中国教育部/国务院学位办全国百篇优秀博士论文奖
2000年:中国遗传学会优秀学术论文奖
1999年:中国农业科学院研究生院优秀博士毕业生奖    
1999年:中国农业科学院研究生院优秀博士论文奖
1996年:中国农业科学院研究生院优秀硕士论文奖
 
学术服务和社会兼职:
美国国家科学基金植物基因组研究项目函审和会审专家
美国交通部能源研究项目函审和会审专家
美国国民研究与发展基金会项目函审专家
中国自然科学基金生物学部函审和会审专家
国际学术出版社 Springer 审稿专家
国际学术期刊 Frontier in Plant Genetics and Genomics 审稿编辑
国际学术期刊 American Journal of Molecular Biology 编辑
国际学术期刊 Crop Journal 编辑
中国学术期刊《大豆科学》海外编委
国际学术期刊 Nature Genetics, PNAS, Genome Research, Plant Cell, Plant Journal, Plant Physiology, Molecular Biology and Evolution, Genome Biology and Evolution, Molecular Phylogenetics and Evolution, Nucleic Acids Research, PLoS Genetics, Genetics, BMC Genomics, BMC Plant Biology, BMC Evolutionary Biology, Mobile DNA, Theoretical and Applied Genetics, Genome, BioScience, Plant Breeding, Plant Science, Crop Science, HortScience, Plant Molecular Biology Report, Journal of Genetics and Genomics, Journal of Integrative Plant Biology等40余家著名SCI期刊审稿专家
《Brenner’s 遗传百科全书》第二辑特邀作者
历届国际动植物基因组大会转座子分会主席(自2006年)
第八届世界大豆研究大会基因组分会主席(2008年)
第12届大豆分子细胞生物学大会组委会委员 (2008年)
美国大豆基因组决策与计划会议特邀专家成员(2010年)
美国生物学家学会会员
美国科学促进学会会员
美国大豆协会会员
美国Sigma Xi 国家荣誉学会会员
 
近期代表性论文:
Zhao, M., Du, J., Lin, F., Tong, C., Yu, J., Huang, S., Wang, X., Liu, S., and Ma, J. Shifts in evolutionary rate and intensity of purifying selection between two Brassica genomes revealed by analyses of orthologous retrotransposons and relics of a whole genome triplication. Plant J. 2013 (accepted)
Lin, F., Zhao, M., Ping, J., Johnson, A., Zhang, B., Abney, T.S., Hughes, T.J., and Ma, J. Molecular mapping of two genes conferring resistance to Phytophthora sojae in a soybean landrace PI 567139B. Theor. Appl. Genet. 2013 [Epub ahead of print]
Tian, Z., Zhao, M., She, M., Du, J., Cannon, S.B., Liu, X., Xu., X., Li, M.-W., Lam, H. -M., and Ma, J. Genome-wide characterization of non-reference transposons reveals evolutionary propensities of transposons in soybean. Plant Cell, 24(11): 4422-4436, 2012
Du, J., Tian, Z., Sui, Y., Zhao, M., Song, Q., Cannon, S.B., Cregan, P., and Ma, J. Pericentromeric effects shape the patterns of divergence, retention, and expression of duplicated genes in the palaeopolyploid soybean (Glycine max (L.). Plant Cell 24(1): 21-32, 2012
Tian, Z., Yu.Y., Lin, F., Yu, Y.-S., SanMiguel, P., Wing, R.A., McCouch, S., Ma, J., and Jackson, S.A. 2011. Exceptional lability of a genomic complex of rice and its close relatives. BMC Genomics, 12: 142
Du, J., Tian, Z., Hans, C., Laten, H., Jackson, S., Cannon, S. Shoemaker, R. Ma, J. 2010. Evolutionary conservation, diversity and specificity of LTR-retrotransposons in flowering plants: new insights from genome-wide analysis and multi-specific comparison. Plant J. 63: 584-598.
Tian, Z., Wang, X., Lee, R. Li, Y., Specht, J.E., Nelson, R.L., McClean, P.E., Qiu, L., and Ma, J. 2010. Artificial selection for determinate growth habit in soybean. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107:8563-8568.
Du, J., Grant, D., Tian, Z., Nelson, R.T., Zhu, L., Shoemaker, R.C., and Ma, J. 2010. SoyTEdb: a comprehensive database of transposable elements in the soybean genome. BMC Genomics 11: 113.
Du, J., Tian, Z., Schmutz, J., Bowen, N.J., Shoemaker, R.C., and Ma, J. 2010. Bifurcation and enhancement of autonomous-nonautonomous retrotransposon partnership through LTR swapping in soybean. Plant Cell 22: 48-61
Schmutz, J., S.B. Cannon, J. Schlueter, J. Ma, D. Hyten, Q. Song, T. Mitros, W. Nelson, G.D. May, (…many others…), Shoemaker, R.C., and Jackson. S.A. 2010. Genome sequence of the paleopolyploid soybean (Glycine max (L.) Merr.). Nature 463: 178-183).
Tian, Z., Rizzon, C., Du, J., Liu, Z., Bennetzen, J.L., Jackson, S.A., Gaut, B.S., and Ma, J. 2009. Do genetic recombination and gene density shape the pattern of DNA elimination in rice LTR-retrotransposons? Genome Res. 19: 2221-2230.
Wu, J., Fujisawa, M., Tian, Z., Yamagata, H., Ma, J., Sasaki, T., and Matsumoto, T., 2009. Comparative analysis of complete orthologous centromeres from two subspecies of rice reveals rapid variation of centromere organization and structure. Plant J. 60: 805-819。

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