实验室在原有“山东省应用真菌重点实验室”基础上，依托青岛农业大学，联合中国海洋大学和青岛蔚蓝生物集团有限公司，于2025年9月整合组建“山东省微生物资源挖掘与创新利用重点实验室”。依托实验室国家和省级人才在微生物学、植物病理学和化学生物学的交叉学科优势，实验室定位前沿技术研究，瞄准建设绿色农业和蓝色粮仓的国家和山东省重大战略需求，践行“大食物观”，解决微生物资源利用的科技创新问题。实验室围绕微生物资源高通量挖掘与生命特征、微生物催化与转化机制认知、微生物与动植物生态互作解析、微生物合成系统设计与突破性产品开发四个研究方向，聚焦农业和海洋真菌、细菌等微生物的生命特征、基因功能、酶催化设计、代谢物调控合成等重大科学问题，开展攻关研究；突破基因组设计重塑与功能分子生物再造、微生物促动植物提质增效与病害绿防、生物制品创制与高效生产等核心科技问题，创新新技术和新方法，建成国内领先的微生物资源利用科技创新平台，领跑山东省微生物资源产业创新发展。

实验室现有科研用房8000余平方米，拥有科研仪器设备原值10140余万，并将30万以上设备纳入省大型科研仪器开放共享服务平台。现有固定人员67人，包含学术带头人14名，研究骨干22名，一般研究人员28名，技术人员2名，辅助管理人员1名。其中教授35人，国家优青1人，国家青年长江学者1人，国家万人1人，国家青拔1人，国家现代农业产业体系岗位专家3人，省杰青1人，省优青7人，泰山学者12人，省重点实验室首席专家1人，省农业体系岗位专家3人，每年培养研究生100余人。近五年承担了国家杰出青年基金项目、国家面上项目等国家级项目80余项，经费6400余万元，承担省部级项目80余项；建成了山东省内农业和海洋微生物综合资源最丰富的种质库，在微生物资源发掘、动植物病害绿防、生物分子高效合成领域的成果在Nature Microbiology、Nature Plants、Nature Communications等国际顶级期刊发表论文100余篇，授权国家发明专利140余项，制定行业标准11项，并获山东省一等奖3项，省部级二等奖等奖励18项，实现成果转化3200余万元。实验室在菌物资源与代谢的科研与教育中发挥了引领性作用，为我省建设成功能菌资源储备和资源利用领先的强省贡献力量。